In den Arbeitsgruppen werden die Handlungsfelder der Metropolregion Mitteldeutschland in Form konkreter Projekte bearbeitet. Gleichzeitig bilden sie die zentrale Schnittstelle für die Zusammenarbeit mit Akteuren aus der öffentlichen Verwaltung, der Wirtschaft, Wissenschaft und Kultur. Als solche stehen sie allen interessierten Akteuren der Region offen.

Derzeit sind folgende Arbeitsgruppen tätig:

AG Wirtschaft und Wissenschaft
AG Kultur und Tourismus
AG Verkehr und Mobilität
AG Familienfreundlichkeit
AG Überregionale Kooperation