Die Aufgabe der Geschäftsstelle ist es, die organisatorischen und verwaltungstechnischen Grundlagen für die Arbeit der Metropolregion Mitteldeutschland zu schaffen und die Kooperation zwischen den Akteuren zu kordieren. Darüber hinaus bereitet sie die Ausschusssitzungen organisatorisch und inhaltlich vor und verantwortet die Finanzierung und Umsetzung aller laufenden Projekte. Auch die Öffentlichkeitsarbeit der Metropolregion obliegt ihrem Zuständigkeitsbereich.